经过多年的努力，我校建成了以院士为龙头、博士后流动站为基地、药品研究基地为平台、重点实验室为支撑、优秀中青年人才为骨干的理工医结合、中西医结合、生物高技术、 公共卫生与预防医学 等四大优势学科群。

      在理工医结合学科群中，拥有1名中国工程院院士（钟世镇）、1名“973”项目首席科学家（陈武凡），是中国医学图像学会理事长单位、《中国医学物理学》和《中国临床解剖学》2个核心期刊主编单位，是大型医疗仪器国家军队标准的制定单位。其中的生物医学工程为一级博士学位授权学科，在2002年全国理工类一级学科评估中，综合实力就已经达到了全国第八，“科学研究”得分名列全国第三，近两年来又取得了重大发展。

      在中西医结合学科群中，拥有一级博士学位授权学科、国家级重点学科、中药和西药国家级临床药理基地，拥有3名院士候选人，2名全国科技先进工作者和4名中央保健组专家等大批知名专家学者。“十五”以来，在中医中药方面获得的国家自然基金18项，名列全国28所中医药大学中的第4位。

        公共卫生与预防医学学科群，原是全军“2110”重中之重建设学科，是全军指定的南方战区核、化、生等突发卫生事件应急和救治中心，是我军国际维和部队医疗队的专门培训机构，是广东省热带医学理事长单位、广东省预防医学领域的重点学科、重点实验室。该学科汇聚了我国防生物战部分创始人，拥有国务院学科评议组专家、“863”计划主题专家、国家科技奖评审专家等一批知名专家。建成了国内第一家数字化人体热气候仿真室、广东省最早的P3实验室（广东省4个之一）和广东省首家生物技术中试基地等一批国内一流的公共卫生研究实验室群。在SARS肆虐期间，作为流行病调研组组长和心理治疗组组长单位，并承担了全国第1例SARS患者尸体的解剖任务。目前，该学科已成为广东省开展突发公共卫生事件应急反应技术研究和应对的支撑平台和骨干力量。